Com todas as cartas Clow recapturadas e transformadas em suas próprias cartas Sakura, Sakura Kinomoto agora entra em seu primeiro ano na Tomoeda Middle School. Após seu primeiro dia de aulas, Sakura se reúne com seu amor Shaoran Li, que a informa que está se mudando permanentemente para Tomoeda. Para sua surpresa, descobriu-se que Shaoran freqüentaria a mesma escola e parecia que a vida de Sakura estava indo na direção certa. No entanto, quando Sakura vai dormir, ela encontra em seu sonho uma misteriosa figura encoberta e se encontra cercada por cartas transparentes. Acordando com medo, Sakura fica chocada ao ver que seu sonho se tornou realidade, com as cartas Sakura se tornando claras. Continuados encontros oníricos com o inimigo desconhecido e sua conquista de uma nova chave mágica definem o cenário para a mais recente aventura de Cardcaptor Sakura! [Escrito por MAL Rewrite]