Com cinco novos filhos e uma nova missão emocionante no mundo digital, Digimon Frontier traz de volta toda a grande ação e aventura das últimas três temporadas. Takuya, Kouji, Izumi, Junpei. e Tomoki se encontram em um trem que os leva ao Mundo Digital, onde uma guerra contra o mal está sendo travada. O digimon anjo, Cherubimon, um dos três anjos enviados para salvar o mundo do faminto de poder Lucemon, virou-se para o lado negro e todo o mundo digital está em perigo. Para lutar esta grande batalha, os cinco ESCOLHIDOS devem encontrar o Densetsu no Spirit (Legendary Spirit).