Os protagonistas de Futari wa Precure, Nagisa Misumi e Honoka Yukishiro, são tão diferentes quanto duas pessoas podem ser. Nagisa é a capitã do time de lacrosse, uma amante da comida e uma avessa ao dever de casa. Honoka adora aprender, trabalhando com o clube de ciências e ganhando o apelido de "A Rainha do Conhecimento" de seus colegas de classe. Suas vidas estão desconectadas até um dia, quando uma misteriosa chuva de estrelas os une. Nagisa e Honoka conhecem Mipple e Mepple, dois residentes do Jardim da Luz. Sua terra natal foi conquistada pelas forças do mal da Zona Negra, que agora têm seus olhos postos no Jardim do Arco-íris: a Terra. Com poderes do Jardim da Luz, Nagisa se torna Cure Black e Honoka se torna Cure White. Juntos, eles são Pretty Cure! Agora, Pretty Cure deve localizar as pedras do prisma, o único poder forte o suficiente para derrotar a Dark Zone e reparar os danos causados ao Garden of Light. Essas garotas mágicas serão capazes de proteger sua casa do mal que a ameaça? Ou eles serão sugados para a escuridão?