Aqueles que recebem a Revelação de Babel devem superar muitas batalhas e provações. Ao agarrar a mão de seu parceiro especial, esses "Hand Shakers" transportam-se para o reino de Zigurate, uma dimensão alternativa onde o tempo não existe mais. Cada par de Hand Shakers deve batalhar pelo direito de se encontrar com Deus, que os recompensará concedendo um único desejo. Tazuna Takatsuki, um estudante do ensino médio com tendência para consertar as coisas, é um desses Hand Shakers. Depois de receber um pedido de reparos do Professor Makihara de uma universidade próxima, Tazuna se depara com Koyori Akutagawa, uma garota acamada que o lembra de sua falecida irmã Musubu. Lembrando-se de seu desejo de nunca largar sua mão, Tazuna agarra a mão de Koyori e desperta seu poder como um Hand Shaker. No entanto, a vida de Koyori está diretamente ligada ao seu status de Hand Shaker, o que significa que se Tazuna soltasse sua mão, ela morreria. Com o encontro com Deus sendo sua única esperança de salvá-la, a dupla deve encontrar uma maneira de unir seus poderes únicos, superar os Shakers opostos e tornar seu desejo realidade. [Escrito por MAL Rewrite]