Midgar, uma academia só para garotas, teria se destacado apenas pela ação de aceitar seu primeiro e único aluno, Yuu Mononobe. Mas Midgar se destaca por muito mais do que isso: é uma escola exclusiva para um grupo de meninas conhecido como D's. Cada um deles tem habilidades extremamente poderosas para gerar matéria escura e manipulá-la em armas poderosas. Os D's não existiam vinte e cinco anos atrás, e só apareceram depois que uma série de monstros misteriosos e destrutivos conhecidos como "Dragões" começaram a aparecer ao redor do mundo. Estranhamente, tão repentinamente quanto apareceram, eles desapareceram. Em seu rastro destrutivo, algumas garotas começaram a nascer com símbolos em seus corpos e poderes semelhantes em natureza aos exercidos pelos próprios dragões. Agora, os D's frequentam esta escola, na esperança de controlar e utilizar seus poderes contra os Dragões. Yuu é o seu último membro e é extraordinário por ser o único homem D conhecido que existe. Agora ele deve estabelecer relacionamentos com as garotas ao seu redor, incluindo sua irmã há muito separada que também frequenta a escola, e trabalhar com elas para investigar e eliminar a ameaça dos poderosos Dragões.