No país de Gazth-Sonika, grassa a guerra civil. Lá, um mercenário chamado Madlax exerce seu ofício, com habilidade quase sobrenatural. No aparentemente pacífico país de Nafrece, Margaret Burton vive uma vida tranquila. Por mais separadas que suas vidas possam parecer, os dois estão conectados por laços de mistério e por um livro sagrado que também é procurado pela organização sombria, Enfant. Conforme Margaret e Madlax seguem o caminho de seu destino, elas se aproximam cada vez mais de descobrir a verdade - sem nenhuma garantia de que seja uma verdade que suportem aprender. (Fonte: ANN)