Na segunda temporada, a história continua exatamente de onde parou anteriormente. A adega de fermentação e o laboratório do professor Itsuki estão prontos para operação e com o dom único de Sawaki Tadayasu de ver e se comunicar com micróbios para ajudar, o heterogêneo grupo de alunos de Itsuki começa a processar diferentes produtos fermentados como molho de soja e saquê. (Fonte: ANN)