Algum tempo depois de todos os eventos que ocorreram durante o primeiro ano de Negi como professor, a Classe 2-A faz uma viagem escolar a uma bela ilha para as férias de primavera. Tudo está bem agora, mas os problemas continuam para Negi, porque ele ainda é a principal atração da classe. Mas ele tem outra coisa com que se preocupar, Asuna está com raiva dele porque ele disse que ela não tinha nada a ver com seus estudos como um bruxo. Durante a viagem, a situação se intensifica quando os amigos de Asuna tentam ajudar Negi a fazer as pazes com ela.