Em um mundo pós-apocalíptico dominado por "Machine Lifeforms" criadas por alienígenas, a humanidade está se preparando para sua última resistência. Forçados a recuar para a Lua por segurança, os humanos depositam suas esperanças em um grupo de andróides artificiais conhecidos como soldados YoRHa. Liderados pelo andróide de batalha para todos os fins YoRHa 2-gou B-gata "2B", o grupo lutará para recuperar o controle da Terra de seus invasores. À medida que a guerra contra as máquinas avança, os YoRHa lentamente começam a ver os primeiros fragmentos da verdade por trás do conflito brutal. Enfrentando a dura realidade diante dela, a inabalável guerreira 2B começa a questionar sua própria existência e o quanto ela deve sacrificar pelo bem da humanidade.