Em uma tarde ensolarada em seu apartamento em Paris, a assassina de aluguel Mireille Bouquet recebe um estranho e-mail de Kirika Yuumura, uma jovem estudante do Japão, convidando-a a "fazer uma peregrinação ao passado" juntas. Inicialmente pensando que o e-mail era um absurdo, ela mudou de ideia quando ele começou a tocar uma música que ela reconheceu de sua juventude. Ao se conhecerem pessoalmente, os dois são repentinamente emboscados por homens armados. Enquanto Mireille é capaz de se defender do ataque, ela descobre que Kirika é bastante hábil em situações de combate depois de matar vários atiradores sozinha. Apesar de sua proficiência em matar, Kirika lamenta sua incapacidade de sentir remorso por suas vítimas. Além disso, Kirika aparentemente não se lembra de como ela adquiriu as habilidades que possui ou mesmo de sua verdadeira identidade. Sentindo uma história compartilhada entre eles, Mireille concorda em se juntar a Kirika e, juntos, eles embarcam em uma jornada para descobrir os mistérios de seu passado. Operando sob o codinome "Noir", a frágil aliança da dupla é testada conforme eles começam a aceitar empregos, cada um os aproximando da verdade de quem eles realmente são. [Escrito por MAL Rewrite]