Nos últimos anos da era Bakumatsu, viveu um lendário assassino conhecido como Hitokiri Battousai. Temido como um assassino impiedoso, ele era incomparável em todo o país, mas desapareceu misteriosamente no auge da Revolução Japonesa. Faz dez anos pacíficos desde então, mas a própria menção a Battousai ainda causa terror nos corações dos veteranos de guerra. Sem o conhecimento deles, Battousai abandonou seu estilo de vida manchado de sangue em um esforço para se arrepender de seus pecados, agora vivendo como Kenshin Himura, um espadachim errante, com uma atitude alegre e uma vontade forte. Jurando nunca mais matar, Kenshin se dedica a proteger os fracos. Um dia, ele encontra Kaoru Kamiya em seu kendo dojo, que está sendo ameaçado por um impostor que afirma ser Battousai. Depois de receber ajuda de Kenshin, Kaoru permite que ele fique no dojo, e assim o ex-assassino cessa temporariamente suas viagens. Rurouni Kenshin: Meiji Kenkaku Romantan conta a história de Kenshin enquanto ele se esforça para salvar aqueles que precisam ser salvos. No entanto, quando inimigos do passado e do presente começarem a surgir, o assassino reformado será capaz de defender seus novos ideais?