Um dia, depois da escola, o estudante do primeiro ano do ensino médio Yomogi Asanaka se depara com um homem faminto debaixo de uma ponte. Apresentando-se como Gauma, o estranho errante informa a Yomogi que ele é um "usuário de kaiju", uma pessoa que lida com os "kaiju" - monstros que causam danos à cidade e seus cidadãos. Na noite seguinte, Yomogi encontra Gauma e seu colega Yume Minami. Simultaneamente, um kaiju aparece em uma área populosa da cidade. Devido à falta de experiência de Gauma em controlar o kaiju, ele tira um objeto misterioso de uma bolsa brilhante, convocando um robô gigante conhecido como Dynazenon. Exigindo a cooperação de quatro pessoas, o mecha arrasta Gauma, Yomogi, Minami e Koyomi Yamanaka - um homem desempregado que vagava pela rua - para sua cabine. Seu encontro com o kaiju marca o início de seu envolvimento com eugenistas kaiju - usuários de kaiju que manipulam kaiju com más intenções - e seus esforços para trazer à tona todo o potencial do Dynazenon. [Escrito por MAL Rewrite]