Apesar da derrota de Quinella - o pontífice da Igreja Axiom - as coisas ainda não pareciam se acalmar. Ao entrar em contato com o mundo real, Kazuto "Kirito" Kirigaya descobre que a tartaruga do oceano - um mega-flutuador controlado por Rath - foi invadida. Devido a um curto-circuito repentino causado pelos invasores, a luz flutuante de Kirito é danificada, deixando-o em coma. Sentindo-se insegura sobre as pessoas da Igreja Axiom, Alice traz Kirito inconsciente de volta para sua cidade natal, Rulid Village, desconsiderando seu banimento devido a um crime não resolvido. Agora, Alice está vivendo uma vida normal e pacífica perto da aldeia, desejando que Kirito acorde. No entanto, a tragédia acontece quando Alice percebe que o Território Negro já começou a invadir o Império Humano. Retomando seu apelido anterior, Alice Synthesis Thirty, ela promete derrotar o Território Negro para defender o mundo que Kirito e Eugeo trabalharam tanto para proteger. [Escrito por MAL Rewrite]