O ano é T.C. 4767. Quatro mil anos se passaram desde que a humanidade abandonou seu local de nascimento, o planeta Terra. Assolada pelo alienígena hostil Gnose, a humanidade agora está lutando para encontrar maneiras de derrotar esta ameaça à sua existência. O desenvolvimento do KOS-MOS (um andróide especializado com recursos incríveis) pelo engenheiro da Vector Shion Uzuki foi uma resposta à ameaça. Mas quando sua nave é destruída pela Gnose, Shion e seus companheiros se veem lançados no meio de uma batalha sem lados claros ... (Fonte: Anime-Planet)