Depois de se desviar a anos-luz da Terra, a espaçonave Macross carrega uma cidade de civis e soldados de volta para casa. Eles continuamente lutam contra a ameaça dos Zentradi e Meltrandi, raças alienígenas gigantes com as quais a humanidade trava guerra. Durante uma batalha, o Macross se transforma em um mecha operado pelo piloto de caça Hikaru Ichijou. Impulsionado por uma série de dificuldades, Hikaru se aproxima do ídolo da cidade, Minmay Lynn. Conforme seu relacionamento se desenvolve, no entanto, ele é visto de forma desfavorável por outros devido ao status e popularidade de Minmay. Com a guerra avançando e o estado da Terra desconhecido, Hikaru e seus companheiros soldados lutam contra seus misteriosos inimigos. Durante o derramamento de sangue, Hikaru e Minmay tentam manter seus sentimentos um pelo outro. Minmay coloca seu coração em sua música, o que pode acabar sendo a chave para encontrar a paz. [Escrito por MAL Rewrite]