Voltando para casa em Konohagakure, o jovem ninja comemora a derrota de um grupo de supostos membros da Akatsuki. Naruto Uzumaki e Sakura Haruno, no entanto, se sentem de forma diferente. Naruto está com ciúmes das famílias de felicitações de seus companheiros, desejando a presença de seus próprios pais. Sakura, por outro lado, está com raiva de seus pais embaraçosos e não deseja ter pais. Os dois colidem sobre seus ideais opostos, mas se deparam com um assunto mais urgente quando o mascarado Madara Uchiha aparece de repente e os transporta para um mundo alternativo. Neste mundo, os pais de Sakura são considerados heróis, pois deram suas vidas para proteger Konohagakure do ataque da Raposa de Nove Caudas 10 anos atrás. Consequentemente, os pais de Naruto, Minato Namikaze e Kushina Uzumaki, estão vivos e bem. Incapaz de voltar para casa ou encontrar o mascarado Madara, Naruto e Sakura ficam neste novo mundo e desfrutam das mudanças que sempre desejaram. Tudo parece bem para os dois ninjas, até que surge uma ameaça inesperada que leva Naruto e Sakura não apenas a lutar pela Konohagakure do mundo alternativo, mas também a encontrar um caminho de volta para o seu próprio mundo.