Enquanto cavalgava com Jack Atlas e Crow Hogan, o Stardust Dragon de Yuusei Fudou é capturado por Paradox, um misterioso Turbo Duelista do futuro, durante um Turbo Duel e transformado em um Sin Monster. Com a ajuda do Dragão Carmesim, Yuusei persegue Paradoxo enquanto ele entra em um lapso de tempo, terminando no passado. Durante este tempo, Paradox duela contra Jaden Yuki, que ainda é capaz de usar os poderes de Yubel e do Rei Supremo. No entanto, por esta altura Paradox também havia capturado Cyber ​​End Dragon e Rainbow Dragon e domina Jaden. Ele é salvo graças a Yuusei e ao Crimson Dragon. Jaden informa Yuusei das verdadeiras intenções de Paradox. Ao roubar vários monstros ao longo do tempo e torná-los sombrios, ele planeja matar Maximillion Pegasus, o criador de Duel Monsters, impedindo que o jogo seja criado e fazendo com que os eventos das três séries nunca aconteçam. Yuusei e Jaden concordam em perseguir Paradoxo, o que os leva ao passado e provoca um encontro com o Rei dos Jogos, Yuugi Mutou. No entanto, no momento em que Yuusei e Jaden chegam, Paradox já havia atacado seu tempo, supostamente matando tanto Pegasus quanto o avô de Yuugi, e também conseguiu roubar Blue-Eyes White Dragon e Red-Eyes Black Dragon. Depois de explicar tudo para Yuugi, ele concorda em lutar com Yuusei e Jaden contra Paradox no duelo final de três contra um para libertar os monstros presos e salvar o mundo e o próprio tempo antes que seja tarde demais. (Fonte: Wikipédia)